Les quatre derniers épisodes de The Clone Wars se déroulent en même temps que Revenge of the Sith, le dernier film de la trilogie préquelle de Star Wars. Cela inclut l'Ordre 66 et la chute de l'Ordre Jedi.
Un aspect inconnu de Star Wars était la façon dont le favori des fans, Ahsoka Tano, a survécu à l'Ordre 66. Les deux derniers épisodes de la série montrent comment Ahsoka s'est échappé.
Brisé
Dans les neuvième et dixième épisodes de la saison, Dark Maul a tendu un piège dans l'intention de tuer Anakin Skywalker avant que Dark Sidious ne puisse le faire basculer du côté obscur. Cependant, Anakin était occupé à sauver le chancelier Palpatine du général Grievous, comme le montre la séquence d'ouverture de Revenge of the Sith. Ahsoka a donc affronté Maul à la place. Le dixième épisode se termine par la capture de Maul.
Le coureur de la série Dave Filoni a déclaré à Entertainment Weekly: "Ce que je voulais faire depuis longtemps, c'est que la fin de Clone Wars soit cette histoire coïncidente qui encadre certaines de ces personnes qui n'étaient pas dans les films sont. Parce que je pense que cela seul est une question valable: où étaient ces gars ? Ahsoka semblait être importante, alors a-t-elle été invitée à rejoindre les Sith ? Où était Rex ? J'avais l'impression que cela avait besoin d'une réponse parce qu'ils étaient, après tant d'épisodes et d'histoires, évidemment une si grande partie de la vie d'Anakin et d'Obi-Wan."
Dans le onzième épisode, intitulé "Shattered", Ahsoka tente d'amener Maul sur Coruscant avec un commandant clone nommé Rex et un bataillon de soldats clones. Plus de liens vers Revenge of the Sith se produisent. Une scène du film est recréée; dans la scène, Mace Windu et Yoda discutent de Palpatine et de sa destitution après la défaite du général Grievous avec d'autres membres du conseil Jedi. La scène se prolonge par une discussion suivante avec Ahsoka.
Alors qu'ils voyagent encore dans l'espace, Ahsoka et Maul sentent tous deux la chute de l'ancien maître d'Ahsoka. L'enregistrement du dialogue réel de Revenge of the Sith avec Hayden Christensen, Samuel L. Jackson et Ian McDiarmid dans le rôle de leurs personnages respectifs jouant sur la scène.
Après le tour d'Anakin, Sidious active l'Ordre 66. Des jetons inhibiteurs ont été placés dans chaque soldat clone. Lorsque l'Ordre 66 est déclaré, ils sont obligés de tuer tous les Jedi contre leur propre volonté. Une fois l'ordre donné, Rex et ses clones attaquent Ahsoka.
Victoire et mort
Avec le libre arbitre de Rex restauré, les deux tentent d'échapper au croiseur de la République dans la finale de la série intitulée "Victory and Death". Ceci est rendu plus compliqué par Maul qui détruit l'hyperdrive du navire. Cela rend le croiseur pratiquement inutile car il est tiré par la gravité d'une lune.
Alors que le croiseur se dirige vers la surface de la lune, Maul s'échappe à l'aide d'une navette vraisemblablement vers la Bordure Extérieure où il devient connu sous le nom de Crimson Dawn comme on le voit dans Solo: A Star Wars Story.
Rex et Ahsoka utilisent un Y-Wing pour atterrir en toute sécurité sur la surface de la lune alors que le croiseur s'écrase, tuant tous les clones à bord. Les deux enterrent leurs camarades décédés et Ahsoka laisse son sabre laser sur la tombe.
L'épisode se termine avec un bataillon de soldats de la tempête surveillant le site de l'accident maintenant recouvert de neige. Dark Vador est avec eux. Vader trouve le sabre laser d'Ahsoka; celui qu'il lui avait offert dans "Old Friends Not Forgotten", le neuvième épisode de la dernière saison.
Filoni a déclaré à ABC News: "J'espère que les fans partiront d'un niveau très satisfaits, et j'espère qu'ils repartiront avec une meilleure compréhension, en particulier des Jedi et de la force, et de ce que tout cela signifie dans cette histoire. Il s'agit vraiment de la caractères à la fin."
Après la guerre des clones
L'histoire d'Ahsoka continue après la série. Le roman Ahsoka, écrit par E. K. Johnston, suit le voyage d'Ahsoka un an après l'Ordre 66 et raconte comment elle a rencontré Bail Organa, le père adoptif de Leia, et a rejoint la rébellion.
Ahsoka apparaît dans les deux premières saisons de Star Wars Rebels qui se déroule 14 ans après The Clone Wars en tant qu'agent rebelle. Au cours de la deuxième saison, Ahsoka découvre la vérité que son ancien maître, Anakin Skywalker, est Dark Vador. Les deux combats et le sort d'Ahsoka sont restés ambigus. Cependant, dans la saison quatre, il a été révélé qu'Ahsoka avait été sauvé par Ezra, le personnage principal de la série. Ahsoka vit pour voir la fin de l'empire.
Ahsoka a fait une apparition dans The Rise of Skywalker et on dit qu'elle apparaîtra dans la deuxième saison de The Mandalorian.
